אחת התוכניות הותיקות והחשובות במכלול היא התכנית "מכלול לבוגרים".

התלמידים בתכנית זו הינם בוגרי צבא וישיבה שמעוניינים ללמוד לימודים אקדמאים איכותיים בשילוב לימודי תורה ברמה גבוהה.
התלמידים יכולים להשתלב במגוון המגמות המוצעות במכלול ולקבל תעודת הנדסאי לאחר שנתיים לימודים בלבד.

בוגרי צבא תוך שנתיים מיום שחרורם זכאים לקבל 80% מימון מדמי שכר הלימוד לשנה הראשונה.
תלמידים נשואים זכאים לקבל מלגה נוספת.

כמו כן, ישנה אפשרות למעונות באיכות גבוהה ובעלות סבירה.